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摄影作品收藏约有50万张照片，涵盖了从1850年代到当代创作的亚洲大部分国家。收藏内容丰富，既包括遗址和收藏品的记录，也涵盖了新闻摄影、家庭摄影、旅行摄影、商业摄影以及殖民地摄影等多个领域。

博物馆的图书馆自1889年开馆以来便开始建设，如今专注于东亚及远东地区的古代艺术与考古学。图书馆的藏书包括欧洲和亚洲的书籍与期刊，总量超过10万册，其中包括1500种期刊。其古籍珍藏尤其丰富，包括17至18世纪的欧洲古籍与旅行文学作品、江户时代的日本插图书籍、中文和韩文的经书、藏文与蒙古文书籍，以及清朝的中国地图等。

吉美博物馆的织物收藏主要源自法印学者和历史学家克里希纳·里布（Krishnâ Riboud）的捐赠。这是全球最重要的亚洲纺织品收藏之一，包括近3800件织物及150件相关物品。

日本艺术部分约11,000件收藏，全面呈现了从日本艺术的起源到1868年明治时代来临的丰富多样的艺术风貌，同时还包含现代和当代艺术作品。

中国佛教艺术与中亚艺术收藏主要来自法国探险考察，展现了古丝绸之路东段商旅队伍行进路线的沿途各大佛教中心的艺术风貌。

吉美博物馆的中国艺术部分约20,000件藏品，跨越了中国七千年的艺术史，从遥远的新石器时代到清朝末期（1911年）及现当代艺术。其中，古代青铜器（包括著名的卡蒙多象尊）和瓷器使其成为西方最重要的中国艺术收藏之一。

印度世界相关的收藏包括从公元前三千年到公元18至19世纪的雕塑、15至19世纪的细密画，以及来源于16至19世纪印度皇家宫廷的家具、装饰品和珠宝。